是的，Linux系统上的jconsole可以监控所有正在运行的Java应用。通过使用jconsole，用户可以查看Java虚拟机（JVM）的运行状态、性能指标和线程信息等。用户只需在终端中输入jconsole命令，然后选择要监控的Java进程即可。请注意，jconsole需要在Java安装目录中的bin文件夹中执行。