Java运行命令（java -jar your_project.jar）通常用于运行小型到中型项目，特别是那些已经打包成可执行JAR文件的项目。对于大型项目，这种方法可能不是最佳选择，原因如下：
依赖管理：大型项目通常有很多外部依赖库。将这些依赖打包到单个JAR文件中可能会导致版本冲突和其他问题。使用构建工具（如Maven或Gradle）可以更好地管理这些依赖关系。
类路径管理：大型项目可能需要将许多JAR文件添加到类路径中。使用构建工具可以自动处理这个问题，而无需手动编辑类路径。
模块化和可扩展性：大型项目通常具有多个模块和组件。使用构建工具可以帮助您更好地组织和管理这些模块，同时提供更好的可扩展性。
性能优化：大型项目可能需要针对特定环境或硬件进行性能优化。使用构建工具可以帮助您更轻松地实现这些优化。
总之，对于大型项目，建议使用构建工具（如Maven或Gradle）来构建、打包和运行项目。这些工具提供了更好的依赖管理、类路径管理、模块化和可扩展性以及性能优化功能。