在R语言中，可以使用不同的方法来对比两组数据的差异。以下是几种常用的方法：
t检验（t-test）：用于比较两组数据的均值之间是否存在显著差异。包括独立样本t检验（针对两组独立样本）和配对样本t检验（针对配对样本）。
方差分析（ANOVA）：用于比较多个组别的均值是否存在显著差异。包括单因素方差分析（One-way ANOVA）和多因素方差分析（Multi-way ANOVA）。
非参数检验：对于不满足正态分布假设的数据，可以使用非参数方法进行差异对比，例如Wilcoxon秩和检验（Wilcoxon Rank Sum Test）和Mann-Whitney U检验。
效应量分析：除了考虑显著性差异外，还可以使用效应量指标来度量两组数据的差异的大小。例如Cohen’s d、Pearson’s r等。
这些方法的选择取决于数据类型、设计和假设的具体情况。需要根据实际情况选择合适的方法进行数据差异的对比分析。