在Java中删除cookie时，可能会遇到以下问题：
获取不到要删除的cookie：如果要删除的cookie不存在或者名称不匹配，可能会导致无法正确删除cookie的问题。
无法删除httponly属性设置的cookie：如果cookie设置了httponly属性，那么通过JavaScript等前端方式无法删除该cookie，只能通过服务端代码进行删除。
Cookie路径设置问题：如果要删除的cookie的路径与当前请求路径不匹配，也会导致无法正确删除cookie的问题。
Cookie域名设置问题：如果要删除的cookie的域名设置与当前请求域名不匹配，也会导致无法正确删除cookie的问题。
Cookie安全属性设置问题：如果要删除的cookie设置了安全属性，那么只有在HTTPS协议下才能正确删除该cookie。
要避免这些问题，可以在删除cookie时，确保cookie的名称、路径、域名、安全属性等设置都正确，并且通过服务端代码来删除cookie。