mirna数据库如何查询数据

查询miRNA数据主要可以通过以下几个常用的数据库进行：

1. miRBase

   • 简介：miRBase是当前收录miRNA信息最全面的综合型公共数据库之一，由曼彻斯特大学研究人员开发。它提供了搜索已发表miRNA序列和注释信息，预测基因靶标等功能。
   • 查询方法：访问miRBase官网（http://www.mirbase.org/），在Search页面可通过输入miRNA的ID、关键词、染色体位置等查询已知的miRNA的信息。也可以提交miRNA序列，以序列比对的方式查找序列相似的已知miRNA。

2. LncBase v3.0

   • 简介：LncBase v3.0是一个用于研究长链非编码RNA（lncRNA）与miRNA（microRNA）相互作用的数据库。它汇总了大量来自文献和公共数据集的信息，包括已知的lncRNA-miRNA相互作用关系。
   • 查询方法：在LncBase v3.0中，只需将目标的lncRNA或miRNA输入到搜索框中，就可以直接进行查询，输出结果会列出具体的详细信息，包括组织类型、参考文献以及可信度等。

3. starbase

   • 简介：starbase数据库通过整合高通量的CLIP-Seq实验数据（CLIP-Seq和HITS-CLIP）和降解组实验数据（degradome sequencing）搜寻microRNA的靶标。提供了各式各样的可视化界面去探讨microRNA的靶标。
   • 查询方法：在starbase数据库中，可以通过输入miRNA名称进行搜索，查找与特定miRNA相互作用的靶基因。

4. miRTarBase

   • 简介：miRTarBase是一个手工收集的，经过实验验证过的miRNA靶基因数据库。它提供了miRNA靶基因的实验验证结果，可以帮助研究者更准确地了解miRNA的功能。
   • 查询方法：访问miRTarBase官网（http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php），在搜索栏中输入miRNA名称进行查询，可以找到与该miRNA相互作用的靶基因信息。

通过上述数据库，您可以查询到关于miRNA的详细信息，包括它们的序列、靶基因、表达模式以及与其他分子的相互作用等。