mirna数据库包含哪些信息

miRNA数据库是专门用于存储和管理微小RNA（miRNA）相关信息的数据库，它们包含了从基础的序列信息到复杂的生物学功能注释等多方面的数据。以下是一些关于miRNA数据库的详细信息：

主要内容

• miRNA序列信息：包括已知的miRNA序列、前体、成熟体等。
• 靶基因预测：通过分析miRNA与靶基因的互作关系，提供靶基因的预测结果。
• 表达谱和调控网络：包含miRNA在不同组织或生物过程中的表达模式，以及参与的调控网络。
• 功能注释：提供miRNA调控的信号通路、与疾病的关联等信息。
• 疾病关联数据：收集实验支持的miRNA与疾病相关数据，帮助研究人员快速查找与特定miRNA相关的疾病信息。

常见的miRNA数据库及其特点

• miRBase：提供全球最全面的miRNA序列信息，包括已知的miRNA序列和注释信息，是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。
• miRTarBase：收集和整合已验证的miRNA靶向关系的数据库，提供大量实验验证的miRNA-mRNA相互作用数据。
• TargetScan：用于预测miRNA靶向基因的数据库，基于miRNA与mRNA的互补匹配原则，通过分析mRNA的3’UTR序列来预测潜在的miRNA靶向位点。
• miRWalk：一个综合性的miRNA靶基因预测数据库，整合了多种预测算法的结果，提供多种miRNA预测工具的比较和综合分析。
• HMDD 4.0：人类microRNA疾病数据库，汇集了实验支持的miRNA与疾病相关数据，提供了超过5000个miRNA和疾病之间的关联信息。

数据库的选择

选择合适的miRNA数据库取决于研究的需求。例如，如果需要查询miRNA基本信息和注释，miRBase可能是一个好的选择。如果希望预测miRNA的靶向基因或分析miRNA靶向关系的可靠性和功能，可以使用TargetScan或miRTarBase。

通过上述数据库，研究人员可以更全面地了解miRNA的功能和调控机制，从而推动miRNA研究的不断深入。