Linux中的mkdir命令用于创建目录，它与文件系统的关系是创建一个新的目录在文件系统中。通过使用mkdir命令，用户可以在任何位置创建新的目录，以便存储文件和其他目录。mkdir命令可以指定目录的名称和路径，如果路径不存在，则会自动创建它。
文件系统是Linux操作系统中用于管理文件和目录的数据结构。当用户使用mkdir命令创建新的目录时，实际上是在文件系统中创建了一个新的目录节点，并为该节点分配一些存储空间以存储文件和其他目录。
因此，mkdir命令与文件系统密切相关，它是在文件系统中创建新目录的主要工具之一。通过使用mkdir命令，用户可以方便地组织和管理文件和目录，使文件系统更加有序和高效。