在进行性能对比时，通常会使用大型输入来测试两者的性能。Java Scanner类和C语言中的scanf函数在处理大量输入时会有明显的性能差异。
Java Scanner类是基于正则表达式实现的，它会逐个字符地扫描输入流，并根据指定的分隔符来划分输入。因此，在处理大量输入时，Scanner类的性能可能会受到正则表达式匹配算法的影响，导致速度较慢。
相比之下，C语言中的scanf函数是基于格式化字符串实现的，它会按照指定的格式读取输入，并且不需要进行正则表达式匹配。因此，在处理大量输入时，scanf函数通常会比Java Scanner类快速并且效率更高。
总的来说，如果需要处理大量输入且对性能要求较高，使用C语言中的scanf函数可能会更加合适。但是在Java中，Scanner类提供了更多的功能和灵活性，适用于一般的输入处理需求。