JPA（Java Persistence API）和MyBatis是两种不同的持久层框架，它们在很多方面有着不同的特点和使用方式。
1. JPA是一种ORM（对象关系映射）框架，而MyBatis是一种半自动化的持久化框架。在JPA中，对象与数据库表之间的映射是自动进行的，开发者无需手动编写SQL语句；而在MyBatis中，开发者需要手动编写SQL语句来实现对象与数据库表之间的映射。
2. JPA是基于标准的Java EE规范，而MyBatis是一个独立的框架，没有依赖于任何规范。
3. JPA提供了更多的高级特性，如一级缓存、查询语言JPQL等，而MyBatis更加灵活，开发者可以自定义SQL语句、结果映射等。
4. 在性能方面，MyBatis通常比JPA更加高效，因为MyBatis可以直接执行手写的SQL语句，而JPA需要将JPQL语句转换为SQL语句执行。
总的来说，选择JPA还是MyBatis取决于具体的项目需求和开发团队的技术背景。如果需要快速开发且对性能要求不高，可以选择JPA；如果对性能要求高且需要更多的灵活性，可以选择MyBatis。