在选择Linux Overlay（特别是OverlayFS）与AUFS之间，主要取决于您的具体需求、系统环境以及对性能、兼容性和功能特性的要求。以下是对这两种文件系统的详细对比分析：
设计理念
- OverlayFS：设计更简单，从Linux 3.18版本开始就进入了Linux内核主线，被认为可能是更快的选择。
- AUFS：虽然功能强大，但代码量较大，且未进入Linux内核，需要手动打补丁和编译。
性能特点
- OverlayFS：支持页缓存共享，copy_up操作更快，因为只有两层结构。
- AUFS：由于多层结构，文件穿越多层较为耗时。
集成程度
- OverlayFS：代码融入到Linux内核中，广泛支持各Linux发行版。
- AUFS：未进入Linux内核，仅在部分Linux发行版中支持。
发展趋势
- OverlayFS：被认为是AUFS的继承者，特别是在Docker社区中的关注度迅速提高。
- AUFS：由于集成难度和性能问题，逐渐被OverlayFS取代。
使用场景
- OverlayFS：适用于需要高性能和良好兼容性的场景，是Docker默认使用的联合挂载技术之一。
- AUFS：适用于需要高级特性和灵活性的场景，但在现代Linux发行版中的支持逐渐减少。
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总的来说，如果您需要一个简单、高性能且广泛支持的解决方案，OverlayFS是更合适的选择。它已经被大多数现代Linux发行版支持，并且在Docker等容器技术中被广泛采用。如果您需要更高级的功能和灵活性，并且不介意使用不在内核中的文件系统，AUFS可能更适合您。然而，考虑到OverlayFS的现代性和广泛支持，它通常是首选。。