在Caffe框架中，处理缺失值通常需要在数据预处理阶段进行。一种常见的处理缺失值的方法是使用均值、中位数或其他统计指标来填充缺失值，这可以通过Caffe提供的数据处理工具来实现。
另一种处理缺失值的方法是将缺失值当做特殊的值，例如可以将缺失值用一个特定的数值或标记来表示，并在网络结构中进行相应的处理。例如，可以在网络的输入层对缺失值进行特殊的处理，或者在网络的损失函数中对缺失值进行相应的处理。
总的来说，在Caffe框架中处理缺失值需要在数据预处理阶段进行，可以根据具体的情况选择合适的方法来处理缺失值。