FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP 是一个Intent的标志，用于将Activity任务栈中位于启动Activity之上的所有Activity都关闭掉，然后再启动目标Activity。
但是FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP可能不起作用的原因有以下几点：
目标Activity没有在任务栈中：FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP 只对已经存在于任务栈中的Activity起作用。如果目标Activity并没有在任务栈中，那么FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP 将会被忽略。
目标Activity在启动模式为singleInstance：如果目标Activity的启动模式为singleInstance，那么FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP将不起作用。因为singleInstance模式的Activity在独立的任务栈中，与其他Activity没有关联。
启动模式为singleTask的Activity已经在任务栈的顶部：如果目标Activity的启动模式为singleTask，并且已经位于任务栈的顶部，那么FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP也不会起作用。因为singleTask模式的Activity在任务栈中只有一个实例，启动时会调用其onNewIntent方法。
目标Activity和启动Activity不在同一个任务栈中：如果目标Activity和启动Activity不在同一个任务栈中，那么FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP将不起作用。因为它只会清除同一任务栈中位于启动Activity之上的Activity。
综上所述，如果FLAG_ACTIVITY_CLEAR_TOP不起作用，可以检查上述情况，以确定问题所在。