PHP Desktop 本身已经提供了一个集成的开发环境，但如果需要自定义开发环境，可以按照以下步骤进行：
配置 PHP 版本：PHP Desktop 默认集成了 PHP 版本，但如果需要使用其他版本，可以在 PHP Desktop 的文件夹中替换或者配置新的 PHP 版本。
配置 Web 服务器：PHP Desktop 默认使用的是 CEF (Chromium Embedded Framework) 作为 Web 服务器，如果需要使用其他 Web 服务器，可以在 PHP Desktop 的配置文件中修改。
添加扩展和插件：可以根据需要添加自己的 PHP 扩展或者第三方插件，可以在 PHP Desktop 的配置文件中启用对应的扩展和插件。
修改界面和样式：可以根据需要修改 PHP Desktop 的界面和样式，可以在 PHP Desktop 的源代码中进行修改。
集成其他工具和库：可以根据需要集成其他工具和库，比如数据库、框架等，可以在 PHP Desktop 的配置文件中进行配置。
总的来说，可以通过修改配置文件、替换文件、添加扩展和插件等方式来自定义 PHP Desktop 的开发环境。