Java PDFReader在处理大文件时可能会遇到性能问题，特别是在内存使用方面。由于PDF文件可能包含大量的内容，如果一次性加载整个文件到内存中，可能会导致内存溢出或性能下降。因此，对于大文件，最好采取一些优化措施，如分批读取或延迟加载等。
另外，Java PDFReader的性能也取决于所使用的PDF解析库。一些优化良好的PDF解析库可能会提供更好的性能和内存管理，能够更有效地处理大文件。因此，在选择PDF解析库时，建议选择经过优化的库，以提高对大文件的处理效率。