在Tomcat中配置JNDI数据源，可以按照以下步骤操作：
1. 打开Tomcat的`context.xml`文件，该文件位于Tomcat的`conf`目录下。
2. 在`context.xml`文件中，添加一个`Resource`元素，用于定义JNDI数据源的配置。`Resource`元素的配置可以包括以下属性：
- `name`：指定JNDI名称，用于在应用程序中引用数据源。
- `auth`：指定数据源的认证方式，可选值为`Container`（使用Tomcat的认证机制）或`Container`（使用应用程序自己的认证机制）。
- `type`：指定数据源的类型，例如`javax.sql.DataSource`。
- `driverClassName`：指定数据库驱动类名。
- `url`：指定数据库连接URL。
- `username`：指定数据库用户名。
- `password`：指定数据库密码。
以下是一个示例的`Resource`元素配置：
3. 保存`context.xml`文件。
4. 在应用程序中，可以通过JNDI名称引用数据源。例如，在Java代码中获取JNDI数据源可以使用以下代码：
Context initContext = new InitialContext();
Context envContext = (Context) initContext.lookup("java:/comp/env");
DataSource dataSource = (DataSource) envContext.lookup("jdbc/myDataSource"); 通过`dataSource`对象，可以进行数据库的连接和操作。
注意：在配置JNDI数据源之前，请确保已经将相应的数据库驱动程序（例如MySQL的驱动程序）放置在Tomcat的`lib`目录下，以便Tomcat能够加载驱动程序。