Java处理GeoJSON的最佳库可能是GeoTools。GeoTools是一个开源的Java库，用于处理地理空间数据，包括GeoJSON格式。它提供了丰富的工具和功能，以方便地读取、写入和操作GeoJSON数据。另外，GeoTools也支持其他常见的地理空间数据格式，如Shapefile、KML等，可以很好地满足地理空间数据处理的需求。因此，如果你需要在Java中处理GeoJSON数据，可以考虑使用GeoTools库。