在Java中，集合（Collection）是一个用于存储和管理多个对象的容器。引用在集合中的应用主要体现在以下几个方面：
存储对象引用：集合可以存储对象的引用，而不是对象本身。这意味着集合中存储的是对象在内存中的地址。这种方式使得集合可以存储多个对象引用，这些对象可以是不同的实例，具有不同的状态和行为。
引用传递：当我们将一个对象添加到集合中时，实际上是将对象的引用传递给集合。因此，当我们从集合中检索对象时，我们得到的是对象的引用，而不是对象的副本。这意味着对集合中的对象进行的任何修改都会影响到原始对象。
避免空指针异常：由于集合中存储的是对象引用，因此在检索对象时，我们需要确保引用的对象不为null。这样可以避免空指针异常。
对象相等性：集合中的对象引用可以根据对象的相等性进行比较。默认情况下，Java中的引用相等性是基于对象的内存地址进行比较的。如果我们需要根据对象的内容进行比较，可以实现equals()方法。
集合类型的选择：Java提供了多种集合类型，如List、Set、Map等，以满足不同的需求。这些集合类型可以根据存储的对象引用的特点进行选择。例如，如果我们需要一个存储唯一对象的集合，可以选择使用Set；如果我们需要一个存储有序对象引用的集合，可以选择使用List。
总之，在Java中，引用在集合中的应用主要是用于存储和管理对象引用，以便在程序中对这些对象进行操作。通过使用不同的集合类型，我们可以根据需要存储和管理对象引用。