在Ubuntu上优化PHP数据库查询性能，可以通过以下几个方面来实现：
选择合适的数据库引擎：根据项目需求选择合适的数据库引擎，如MySQL、PostgreSQL等。不同的数据库引擎在性能和功能上有所差异，选择合适的引擎可以提高查询性能。
优化数据库结构：合理设计数据库表结构，避免冗余数据，使用合适的数据类型，以及合理设置索引。这有助于提高查询速度和减少存储空间。
使用预处理语句：预处理语句可以提高查询性能，因为它们只需要编译一次，然后可以多次执行。在PHP中，可以使用PDO或MySQLi扩展来实现预处理语句。
缓存查询结果：对于重复的查询，可以使用缓存技术来存储查询结果，从而减少数据库负载。在PHP中，可以使用Memcached或Redis等缓存系统。
优化查询语句：避免使用SELECT *，而是只查询需要的字段。尽量减少JOIN操作，特别是在大表之间。使用LIMIT子句来限制返回的结果数量。
分页查询：对于大量数据的查询，可以使用分页技术来减少每次查询的数据量。在PHP中，可以使用LIMIT和OFFSET子句来实现分页查询。
使用慢查询日志：启用数据库的慢查询日志功能，以便找出执行时间较长的查询。针对这些慢查询进行优化，可以提高整体性能。
调整数据库配置：根据服务器的硬件资源和项目需求，调整数据库的配置参数，如内存分配、连接数等。这有助于提高数据库性能。
使用负载均衡和数据库复制：在高并发场景下，可以使用负载均衡技术将请求分发到多个数据库服务器，从而提高性能。此外，可以使用数据库复制功能来分担读取压力。
监控和分析：定期监控数据库性能指标，如查询响应时间、连接数等。使用分析工具找出性能瓶颈，并进行相应的优化。
通过以上方法，可以在Ubuntu上优化PHP数据库查询性能。需要注意的是，优化过程需要根据具体项目需求和服务器资源来进行调整。