在MySQL中，ibdata文件是用来存储InnoDB存储引擎的系统表空间和共享表空间的文件。表空间是InnoDB存储引擎中用来存储数据和索引的逻辑结构，而ibdata文件则是实际存储这些数据和索引的物理文件。
每个InnoDB存储引擎实例都有一个ibdata文件，里面包含了系统表空间和共享表空间。系统表空间存储了一些系统表和元数据信息，共享表空间存储了所有InnoDB表的数据和索引。
当创建一个新的InnoDB表时，该表的数据和索引将被存储在ibdata文件中的共享表空间中。因此，ibdata文件的大小会随着数据库中的数据量的增加而增加。如果数据库中有大量的数据，ibdata文件可能会变得非常大。
总的来说，ibdata文件与表空间之间的关系是ibdata文件用来存储表空间中的数据和索引。ibdata文件的大小取决于数据库中的数据量和表空间的使用情况。