Java SkyWalking通过Agent来管理服务依赖。Agent是一个轻量级的Java代理程序，可以嵌入到应用程序中，并监控和收集应用程序的性能指标和依赖关系。Agent会自动识别并收集应用程序中的服务调用，包括HTTP、RPC和数据库等，然后将这些信息发送给SkyWalking服务器进行分析和可视化展示。
通过Agent的监控和数据收集功能，Java SkyWalking可以帮助用户实时了解服务之间的依赖关系，发现服务调用的性能瓶颈和异常情况，并及时进行分析和优化。同时，Java SkyWalking还提供了丰富的可视化界面和报表功能，帮助用户直观地了解服务依赖关系和性能指标，从而更好地管理和优化服务依赖关系。