MySQL复合主键的查询速度会受到多个因素的影响，包括索引的使用、数据量、查询条件等。一般来说，使用合适的复合主键可以提高查询速度，因为MySQL可以利用索引来快速定位数据。
当使用复合主键进行查询时，MySQL会首先使用第一个字段建立索引，然后再使用第二个字段进行进一步筛选。如果查询条件中包含复合主键的所有字段，那么查询速度会比较快；但如果只使用了部分字段或者没有使用复合主键的字段，查询速度可能会受到影响。
因此，在设计复合主键时，需要考虑查询的频率和条件，保证复合主键包含使用频率较高的字段，并尽量避免使用不必要的字段。此外，还可以通过合理使用索引和优化查询语句等方式来提高查询速度。