MySQL数据库备份加密的方法有以下几种：
使用MySQL内置的加密函数：MySQL提供了一些内置的函数，如AES_ENCRYPT()和AES_DECRYPT()，可以实现对数据的加密和解密。可以在备份数据之前，使用AES_ENCRYPT()函数加密数据，然后备份加密后的数据。在恢复数据时，使用AES_DECRYPT()函数解密数据。
使用第三方工具加密备份文件：可以使用第三方工具，如mysqldump加密选项、Percona XtraBackup等，对备份文件进行加密。这些工具提供了加密选项，可以在备份数据时加密数据。在恢复数据时，需要使用相应的解密方法解密备份文件。
使用文件系统级别的加密：可以使用文件系统级别的加密，如BitLocker、FileVault等，对数据库备份文件进行加密。这样可以保证整个备份文件都被加密，而不只是数据部分。在恢复数据时，需要先解密备份文件，然后再恢复数据。
无论使用哪种方法，都需要注意保护加密密钥的安全，以防止密钥泄露导致数据被解密。