设计一个Java学生管理系统的步骤如下：
确定系统的功能需求：例如，添加学生信息、删除学生信息、修改学生信息、查询学生信息等。
设计数据库表结构：确定学生信息的存储方式，包括学生ID、姓名、年龄、性别等字段。
创建Java类：根据数据库表结构，创建与之对应的Java类，例如Student类。
实现数据库连接：使用Java JDBC连接数据库，创建数据库连接类。
实现功能方法：根据功能需求，在学生类中实现增删改查等方法。
创建用户界面：使用Swing或JavaFX等库创建用户界面，包括添加学生、删除学生、修改学生、查询学生等功能按钮。
实现用户界面与功能方法的交互：将按钮与对应的功能方法进行关联，实现用户界面和功能方法的交互。
测试系统：进行系统测试，确保各功能正常运行。
优化系统：根据测试结果对系统进行优化，提高系统的性能和稳定性。
部署系统：将系统部署到目标环境中，例如本地计算机或服务器。
以上是Java学生管理系统的设计与实现的大致步骤，具体实现过程中还需要根据实际情况进行调整和完善。