在C#中，where子句通常用于LINQ查询中，用于筛选集合中的元素。在复杂查询中，where子句可以用来实现以下功能：
筛选：通过where子句可以根据条件筛选集合中的元素，只返回满足条件的元素。
多条件筛选：可以使用多个条件结合在一起进行筛选，使用逻辑运算符（如&&、||）来组合多个条件。
嵌套查询：可以将多个where子句嵌套在一起，实现复杂的查询逻辑。
筛选集合中的复杂对象：在集合中的元素是复杂对象时，可以使用where子句对对象的属性进行筛选。
总之，where子句在复杂查询中的应用场景是通过条件筛选集合中的元素，实现数据的过滤和筛选功能。