MySQL中使用IN子查询可能会导致查询变慢的原因有以下几点：
子查询返回的结果集过大：如果子查询返回的结果集很大，那么在执行IN操作时需要逐个比对，会增加查询的时间复杂度。
索引不匹配：如果子查询返回的结果集中的列没有合适的索引来支持IN操作，那么MySQL可能会执行全表扫描，导致查询变慢。
子查询的性能问题：子查询本身可能存在性能问题，比如没有使用合适的索引、未优化的查询语句等，也会影响整个查询的性能。
数据量过大：如果表的数据量很大，那么在执行IN操作时需要消耗更多的时间来比对每个值，导致查询变慢。
为了提高查询性能，可以考虑使用JOIN操作或者优化子查询，确保子查询返回的结果集尽可能小且有合适的索引支持。同时，也可以考虑对表的结构和查询语句进行优化，以提高查询性能。