在CentOS系统上集成Fortran与MPI(Message Passing Interface)可以用于高性能计算。以下是详细的步骤和方法:
首先,你需要在CentOS系统上安装MPI库。常见的MPI实现包括MPICH和OpenMPI。以下是使用MPICH的步骤:
下载并解压MPICH:
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.2/mpich-3.2.1.tar.gz
tar -xzvf mpich-3.2.1.tar.gz -C /home/mpiuser/mpich/
cd /home/mpiuser/mpich/mpich-3.2.1/
配置和安装:
./configure --prefix=/home/mpiuser/mpich
make && make install
设置环境变量:
编辑~/.bashrc
文件,添加以下内容:
export PATH=/home/mpiuser/mpich/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/mpiuser/mpich/lib:$LD_LIBRARY_PATH
执行以下命令使配置生效:
source ~/.bashrc
使用Fortran编译器(如gfortran或ifort)编译MPI程序。以下是一个简单的示例程序:
program hello_world_mpi
use mpi
implicit none
integer :: process_rank, size_of_cluster, ierror
call mpi_init(ierror)
call mpi_comm_size(mpi_comm_world, size_of_cluster, ierror)
call mpi_comm_rank(mpi_comm_world, process_rank, ierror)
print *, 'Hello world from process:', process_rank
call mpi_finalize(ierror)
end program hello_world_mpi
使用mpirun
或mpiexec
命令运行编译后的程序。例如:
mpirun -np <core-count> ./hello_world_mpi
或者使用mpiexec
:
mpiexec -np <core-count> ./hello_world_mpi
对于多节点环境,需要进行以下配置:
配置主机文件:
编辑/etc/hosts
文件,确保所有节点可以互相ping通。
设置SSH无密码登录: 在每个节点上生成SSH密钥,并将公钥发送给其他节点。
ssh-keygen -t rsa
ssh-copy-id mpiuser@other_node
在主节点上运行mpirun
或mpiexec
命令,指定所有节点:
mpirun -np <total_core_count> -host node1,node2,node3 ./hello_world_mpi
通过以上步骤,你可以在CentOS系统上成功集成Fortran与MPI,进行高性能并行计算。