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CentOS ForTran与MPI的集成方法

小樊
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2025-02-11 19:59:14
栏目: 智能运维

在CentOS系统上集成Fortran与MPI(Message Passing Interface)可以用于高性能计算。以下是详细的步骤和方法:

1. 安装MPI库

首先,你需要在CentOS系统上安装MPI库。常见的MPI实现包括MPICH和OpenMPI。以下是使用MPICH的步骤:

安装MPICH

  1. 下载并解压MPICH

    wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.2/mpich-3.2.1.tar.gz
    tar -xzvf mpich-3.2.1.tar.gz -C /home/mpiuser/mpich/
    cd /home/mpiuser/mpich/mpich-3.2.1/
    
  2. 配置和安装

    ./configure --prefix=/home/mpiuser/mpich
    make && make install
    
  3. 设置环境变量: 编辑~/.bashrc文件,添加以下内容:

    export PATH=/home/mpiuser/mpich/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/home/mpiuser/mpich/lib:$LD_LIBRARY_PATH
    

    执行以下命令使配置生效:

    source ~/.bashrc
    

2. 编译Fortran程序

使用Fortran编译器(如gfortran或ifort)编译MPI程序。以下是一个简单的示例程序:

program hello_world_mpi
    use mpi
    implicit none
    integer :: process_rank, size_of_cluster, ierror

    call mpi_init(ierror)
    call mpi_comm_size(mpi_comm_world, size_of_cluster, ierror)
    call mpi_comm_rank(mpi_comm_world, process_rank, ierror)

    print *, 'Hello world from process:', process_rank

    call mpi_finalize(ierror)
end program hello_world_mpi

3. 运行MPI程序

使用mpirunmpiexec命令运行编译后的程序。例如:

mpirun -np <core-count> ./hello_world_mpi

或者使用mpiexec

mpiexec -np <core-count> ./hello_world_mpi

4. 配置多节点环境

对于多节点环境,需要进行以下配置:

  1. 配置主机文件: 编辑/etc/hosts文件,确保所有节点可以互相ping通。

  2. 设置SSH无密码登录: 在每个节点上生成SSH密钥,并将公钥发送给其他节点。

    ssh-keygen -t rsa
    ssh-copy-id mpiuser@other_node
    

5. 运行多节点测试

在主节点上运行mpirunmpiexec命令,指定所有节点:

mpirun -np <total_core_count> -host node1,node2,node3 ./hello_world_mpi

参考资源

通过以上步骤,你可以在CentOS系统上成功集成Fortran与MPI,进行高性能并行计算。

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