在Debian系统中，使用crontab设置任务运行目录可以通过以下方法实现：
使用cd命令切换到目标目录：
在crontab文件中，你可以在要执行的命令前添加cd命令来切换到目标目录。例如，如果你想让脚本/home/user/my_script.sh在/var/www/html目录下运行，你可以这样设置：
* * * * * cd /var/www/html && /home/user/my_script.sh
这里，* * * * *表示任务的执行时间，cd /var/www/html表示切换到/var/www/html目录，&&表示当cd命令成功执行后，执行后面的命令，即/home/user/my_script.sh。
使用子shell：
你还可以使用子shell来设置任务运行目录。例如：
* * * * * (cd /var/www/html && /home/user/my_script.sh)
这里的括号()表示一个子shell，它允许你在其中执行多个命令。在这个例子中，我们首先切换到/var/www/html目录，然后执行/home/user/my_script.sh脚本。
注意：在使用这些方法时，请确保你的脚本具有可执行权限。你可以使用chmod +x /home/user/my_script.sh命令为脚本添加可执行权限。