EVLncRNAs数据库有什么用

发布时间:2022-01-17 10:51:55 作者:小新
来源:亿速云 阅读:149

这篇文章主要介绍了EVLncRNAs数据库有什么用,具有一定借鉴价值,感兴趣的朋友可以参考下,希望大家阅读完这篇文章之后大有收获,下面让小编带着大家一起了解一下。

在已有的lncRNA数据库中,包含了两种类型的lncRNA, 一种是实验手段证实过的lncRNA, 另外一种是软件预测出来的lncRNA,其中软件预测的结果是存在很多的假阳性的。

EVlncRNAs是目前最大的实验验证的lncRNA数据库,收录了来自动物,植物,微生物共77个物种,1543个lncRNA, 除了染色体位置,外显子个数,长度等基本信息外,还提供了lncRNA相关的疾病,lncRNA功能注释,lncRNA与其他分子的相互作用等信息,数据库网址如下

http://biophy.dzu.edu.cn/EVLncRNAs/

H19这个lncRNA为例,包含了以下几种信息

1. 基本信息

包括lncRNA id, name, 染色体定位,外显子个数,转录本编号等基本信息,示意如下

EVLncRNAs数据库有什么用

2. lncRNA相关疾病

通过整合了lncRNADisease, lnc2Cancer等数据库以及已经发表的文献,提供了lncRNA相关的疾病信息,示意如下

EVLncRNAs数据库有什么用

3.  功能注释

EVLncRNAs数据库有什么用

4.  相互作用

包括了lncRNA与miRNA, protein, TF等相互作用信息,示意如下

EVLncRNAs数据库有什么用

该数据库中的信息是免费下载的,示意如下

EVLncRNAs数据库有什么用


感谢你能够认真阅读完这篇文章,希望小编分享的“EVLncRNAs数据库有什么用”这篇文章对大家有帮助,同时也希望大家多多支持亿速云,关注亿速云行业资讯频道,更多相关知识等着你来学习!

推荐阅读:
  1. PubMeth数据库有什么用
  2. TFTG数据库有什么用

免责声明:本站发布的内容(图片、视频和文字)以原创、转载和分享为主,文章观点不代表本网站立场,如果涉及侵权请联系站长邮箱:is@yisu.com进行举报,并提供相关证据,一经查实,将立刻删除涉嫌侵权内容。

数据库

上一篇:SomamiR数据库有什么用

下一篇:Python怎么实现自动化发送邮件

相关阅读

您好,登录后才能下订单哦!

密码登录
登录注册
其他方式登录
点击 登录注册 即表示同意《亿速云用户服务条款》