染色质相互作用数据库4DGenome是怎样的

本篇文章给大家分享的是有关染色质相互作用数据库4DGenome是怎样的，小编觉得挺实用的，因此分享给大家学习，希望大家阅读完这篇文章后可以有所收获，话不多说，跟着小编一起来看看吧。

4DGenome是一个染色质相互作用数据库，采用了文献检索和软件预测两种手段来得到染色质相互作用，收录了来自5个不同物种共7百多万条互作记录，网址如下

https://4dgenome.research.chop.edu/

涵盖的5个物种列表如下

1. Homo sapiens(hg19)

2. Mus musculus(mm9)

3. Drosophila melanogaster(dm3)

4. Plasmodium falciparum(3D7)

5. Saccharomyces cerevisiae(sacCer3)

   
   

该数据库中收录的染色质互作信息来源于以下多种技术手段

1. 3C

2. 4C

3. 5C

4. Capture-C

5. ChIA-PET

6. Hi-C

7. IM-PET

   
   

不同物种和不同技术手段对应的数量显示如下

输入基因组区域或者基因名称，都可以检索相关信息，检索框示意如下

检索结果如下所示

点击Details可以查看详细的互作信息，InteractorA和InteractorB给出了互作的两个染色质区域的位置信息，Agene和Bgene表示与互作区域存在overlap的基因名称, Contact Frequency表示互作频率，LInk链接的是pubmed数据库，可以查看对应的具体文献。

通过该数据库，可以检索多个物种的染色质互作信息。

以上就是染色质相互作用数据库4DGenome是怎样的，小编相信有部分知识点可能是我们日常工作会见到或用到的。希望你能通过这篇文章学到更多知识。更多详情敬请关注亿速云行业资讯频道。