C#中的HtmlDocument类可以处理HTML文档，但无法直接处理JavaScript代码。JavaScript代码通常在浏览器中执行，而不是在C#代码中执行。如果您需要执行JavaScript代码并与其交互，您可能需要使用WebBrowser控件或其他类似的工具来模拟浏览器环境并执行JavaScript。