Java信号处理的底层原理是通过JNI（Java Native Interface）来与操作系统的C库进行交互，以实现对信号的处理。在Java中，可以使用sun.misc.Signal类来注册信号处理器，然后通过JNI调用C库中的方法来处理信号。
具体来说，当Java程序接收到信号时，会使用JNI调用C库中的sigaction函数来注册信号处理器。然后，当信号发生时，操作系统会通知Java程序，Java程序再调用之前注册的信号处理器对信号进行处理。
总的来说，Java信号处理的底层原理是通过JNI来与操作系统的C库进行交互，完成对信号的处理。