MySQL协议的监控和日志分析可以通过以下方式进行：
使用MySQL自带的性能监控工具：MySQL提供了一些内置的性能监控工具，如SHOW STATUS、SHOW GLOBAL VARIABLES等命令，可以用来查看数据库的性能指标和配置参数。
使用第三方监控工具：有很多第三方监控工具可以用来监控MySQL的性能，如MySQL Enterprise Monitor、Percona Monitoring and Management等。这些工具可以提供更全面的性能监控和报警功能。
监控MySQL的日志文件：MySQL会生成多种类型的日志文件，如错误日志、慢查询日志、二进制日志等。通过监控这些日志文件，可以了解数据库的运行情况和进行故障排查。
分析MySQL的慢查询日志：慢查询日志记录了执行时间超过指定阈值的SQL查询语句，通过分析慢查询日志可以找出性能瓶颈，优化查询语句。
使用性能分析工具：可以使用性能分析工具如Percona Toolkit、pt-query-digest等来对数据库的性能进行分析和优化。
通过以上方法，可以对MySQL协议进行有效监控和日志分析，帮助提高数据库的性能和稳定性。