在MySQL中，sys_exec函数的执行限制包括：
仅可由具有SUPER权限的用户调用，因此需要确保只有受信任的用户可以调用该函数。
需要在MySQL中启用sys_exec函数，可以通过设置secure_file_priv参数来限制sys_exec函数的使用。
sys_exec函数只能执行操作系统中已有的可执行文件或脚本，而不能执行任意命令。
由于sys_exec函数直接与操作系统交互，可能存在安全风险，因此应避免在生产环境中使用sys_exec函数。