WebDAV协议与FTP在多个方面存在显著差异，具体如下：
功能性
- WebDAV：支持文件的版本控制、写文件锁定及解锁，允许用户直接对Web服务器上的文件进行读写操作。
- FTP：主要用于文件的上传和下载，不支持文件的删除和新建，且需要先获取远程文件的副本后才能修改。
安全性
- WebDAV：可以通过HTTPS运行，提供数据加密和身份验证，安全性较高。
- FTP：传统的FTP协议安全性不高，虽然存在FTPS等加密版本，但部署和配置相对复杂。
传输效率
- WebDAV：传输所有文件只需要一个TCP连接，提高了传输效率。
- FTP：每传送一个文件需要打开一个新的TCP连接，导致传输效率较低。
兼容性
- WebDAV：需要服务器和客户端软件的支持，但许多现代操作系统和服务器软件已内置WebDAV支持。
- FTP：几乎所有的操作系统都支持FTP客户端，服务器端软件也广泛可用。
使用场景
- WebDAV：适合需要文件版本控制、写文件锁定及解锁的场景，如协作编辑和版本控制。
- FTP：适合需要频繁上传和下载文件的场景，如文件共享和备份。
综上所述，WebDAV协议在功能性、安全性、传输效率和使用场景方面相较于FTP具有更多优势，尤其是在需要文件版本控制和写文件锁定及解锁的场景中表现更佳。然而，FTP因其广泛的兼容性和简单的使用方式，在文件上传和下载方面仍然是一个受欢迎的选择。