MongoDB索引优化的方法有以下几种：
确定索引字段：选择合适的字段作为索引字段，通常选择经常被查询的字段或者经常被排序的字段。
创建复合索引：对于经常需要多个字段进行查询的情况，可以创建复合索引来提高查询性能。
索引覆盖：通过创建合适的索引，可以使查询只需要读取索引而不需要读取数据文档，从而提高查询性能。
删除无用索引：定期检查并删除无用的索引，避免对性能产生负面影响。
使用TTL索引：对于需要定期清理的数据，可以使用TTL（Time to Live）索引来自动删除过期的数据。
禁用索引：在某些特殊情况下，可以通过禁用某个索引来强制使用其他更适合的索引。
使用全文索引：对于文本数据的搜索，可以使用全文索引来提高查询性能。
调整索引顺序：根据查询的频率和特点，调整索引的顺序，使得索引的使用更加高效。
避免全表扫描：通过正确使用索引，避免全表扫描，提高查询性能。
使用Hint指定索引：在某些查询中，可以使用Hint指定使用某个特定的索引，避免MongoDB自动选择索引。
需要注意的是，索引优化需要综合考虑查询频率、数据量、查询条件等因素，并根据具体情况进行调整。