在Web应用中，Java线程变量可以用于存储和传递用户会话信息、请求上下文信息等。它可以在同一个线程内的多个方法之间共享数据，避免了在不同方法之间频繁传递参数的麻烦。线程变量可以在整个请求生命周期内保持不变，使得数据在同一个请求内共享并可被多个方法访问。
另外，线程变量还可以用于存储一些全局性的数据，比如数据库连接、缓存连接等，以避免频繁创建和销毁这些资源，提高性能和效率。
总的来说，Java线程变量在Web应用中的用途主要是为了方便数据共享和管理，提高代码的可读性和可维护性，同时也可以提高性能和效率。