在MATLAB中，plotyy与plot函数的主要区别在于它们绘制图形的方式和目的。
plot函数是MATLAB中最基本的绘图函数之一，用于绘制二维图形。它接受一系列x和y的数据点，并在坐标系中绘制出这些点的连线。plot函数可以绘制折线图、散点图等多种类型的图形。plotyy函数则用于绘制双y轴图。这种图形可以在同一个坐标系中显示两个不同y轴的数据系列，使得比较和分析这两个数据系列变得更加容易。plotyy函数接受两个y轴的数据系列，并为每个系列绘制一条折线。这两条折线共享同一个x轴，但分别对应两个不同的y轴。因此，plotyy函数的主要目的是在同一个坐标系中同时显示多个数据系列，而plot函数则主要用于绘制单个数据系列。在使用plotyy函数时，需要注意选择合适的y轴范围和刻度，以确保两个数据系列能够清晰地显示在图形中。
需要注意的是，plotyy函数并不是MATLAB中最新的绘图函数之一，可能在一些较旧的MATLAB版本中不可用。在这种情况下，可以考虑使用其他绘图函数或自定义绘图代码来实现双y轴图的效果。