ANFD-HLA数据库有什么用

这篇文章主要介绍了ANFD-HLA数据库有什么用，具有一定借鉴价值，感兴趣的朋友可以参考下，希望大家阅读完这篇文章之后大有收获，下面让小编带着大家一起了解一下。

在研究SNP时，我们有类似1000G，HapMap, Exac 等数据库，提供了不同人群中的频率信息。对于HLA的研究而言，也有存储频率信息的数据库-ANFD。

官网链接如下

http://www.allelefrequencies.net/default.asp

ANFD全称Allel Frequency Net Database, 存储了HLA, KIR，Cytokine, MIC 共4种人类基因组中多态性较高的突变信息，其中记录了allel, haplotype, genotype 3种格式的信息，最关键的是，提供了在不同人群中的频率信息。

1. Allel 在不同人群中的频率

通过该数据库的检索功能，可以查询HLA Allel在不同人群中的频率分布，网址如下

http://www.allelefrequencies.net/hla6006a.asp

Locus指定HLA基因座，Population指定人群，然后点击Search 按钮即可，上述条件的检索结果如下

2. haplotype 在不同人群中的频率

由于HLA基因簇的紧密连锁性，除了单个Allel的频率外，相关单倍型的频率也是需要关注的。官网也提供了检索单倍型的功能，网址如下

http://www.allelefrequencies.net/hla6003a.asp

通过选择构成单倍型的基因组合，然后进行检索。上述条件的检索结果如下

通过ANFD数据库，我们可以方便的得到HLA的Allel和haplotype在人群中的频率信息，除此之外，官网还提供了许多其他的功能，有待进一步的学习和使用。

感谢你能够认真阅读完这篇文章，希望小编分享的“ANFD-HLA数据库有什么用”这篇文章对大家有帮助，同时也希望大家多多支持亿速云，关注亿速云行业资讯频道，更多相关知识等着你来学习!