lncRNA相关疾病数据库lncrnadisease怎么理解

发布时间:2022-01-15 13:58:09 作者:柒染
来源:亿速云 阅读:134

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有研究表明,长链非编码RNA和许多的生命活动,疾病相关联,比如癌症,心脑血管病,神经退行性疾病等,为了更好的研究lncRNA的功能,开发者收录整理了已经报道的lncRNA和疾病的关联,并整理成了数据库lncrnadisease, 网址如下

http://www.cuilab.cn/lncrnadisease

最新版的数据库中包含了914个lncRNA, 329种疾病, 将近3000个lncRNA与疾病之间的关联信息,还包含了475个lncRNA与其他分子的相互作用信息。

通过Browser功能,可以根据lncRNA或者disease的名称浏览相关记录,以HOTAIR为例,结果示意如下

lncRNA相关疾病数据库lncrnadisease怎么理解

对于lncRNA, 会给出名称,染色体位置,物种,转录本编号,序列等基本信息,同时对于相关的疾病,会给出疾病名称,文献等信息。

除了lncRNA相关的疾病,该数据库还提供了lncRNA和其他分子的相互作用信息,通过Interaction可以查看相互作用信息,以HOTAIR为例,结果示意如下

lncRNA相关疾病数据库lncrnadisease怎么理解

根据相互作用的分子的类型,划分了不同的互作类型,并给出了对应的文献。

该数据库中的数据是开放下载的,而且是txt或者xls格式的,非常的友好。

该数据库其实就是一个文献整理工作的总结,通过该数据库,我们可以方便的得到已经报导的lncRNA相关疾病信息。

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lncrna 数据库

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