lncRNome数据库有什么用

小编给大家分享一下lncRNome数据库有什么用，相信大部分人都还不怎么了解，因此分享这篇文章给大家参考一下，希望大家阅读完这篇文章后大有收获，下面让我们一起去了解一下吧！

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lncRNome是一个综合性的人类lncRNA数据库，中收录了超过17000个lncRNA,网址如下

http://genome.igib.res.in/lncRNome/

在该数据库中，提供了以下几种lncRNA的信息

1. 染色体位置

2. 基因类型

3. 功能描述

4. 相关疾病

   
   

除此之外，利用多组学分析，还提供了以下两种信息

1. lncRNA相互作用的蛋白

2. lncRNA上的SNP位点

3. lncRNA上的甲基化位点/组蛋白修饰区域

   
   

官网提供了多种检索方式，可以通过lncRNA Id, 染色体编号，基因类型等方式进行检索，示意如下

以HOTAIR为例，检索结果包含以下信息

1. 基本信息

这部分包含了lncRNA的name, 类型，染色体定位，长度，相关疾病，文献等信息，示意如下

2. 序列和二级结构

lncRNA的序列来自UCSC，二级结构采用RNAfold软件预测得到，示意如下

3.  与蛋白质的相互作用

4. 位于lncRNA区域的SNP位点

5. 相关的表观修饰

包含了甲基化和组蛋白修饰信息，示意如下

该数据库是免费下载的，可以下载以下数据

以上是“lncRNome数据库有什么用”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！