R语言中聚类函数的应用有哪些

本篇内容介绍了“R语言中聚类函数的应用有哪些”的有关知识，在实际案例的操作过程中，不少人都会遇到这样的困境，接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧！希望大家仔细阅读，能够学有所成！

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）— 最短距离法（single linkage)— 最长距离法 （complete linkage)— 中间距离法 （median method)— 可变距离法 （flexible median)— 重心

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）
— 最短距离法（single linkage)
— 最长距离法 （complete linkage)
— 中间距离法 （median method)
— 可变距离法 （flexible median)
— 重心法 （centroid)
— 类平均法 （average)
— 可变类平均法 （flexible average)
— Ward 最小方差法 （Ward's minimum variance)

在生信行业中，经常会利用到上述聚类方法，对生物数据进行聚类分析，例如R 中常见的相关聚类函数的应用：hclust()参数method:

"single"    最短距离法
"complete"    最长距离法
"median"    中间距离法(=WPGMC）
"average"    类平均法（=UPGMA)
"centroid"    重心法（=UPGMC)
"ward"    离差平方和
"Mcquitty"    相似分析法 (=WPGMA)

需要注意，实际不同语言或不同函数具体的层次聚类方法或有差异，需多加探索。

“R语言中聚类函数的应用有哪些”的内容就介绍到这里了，感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注亿速云网站，小编将为大家输出更多高质量的实用文章！