要使用MySQL和Ruby on Rails开发一个简单的在线问卷调查系统，可以按照以下步骤进行：
安装Ruby on Rails：首先，确保已经安装了Ruby和Rails。可以使用Ruby版本管理器（如RVM或rbenv）来安装和管理Ruby。然后，使用gem命令安装Rails：gem install rails。
创建一个新的Rails应用程序：在命令行中，使用rails new survey_system命令创建一个新的Rails应用程序。进入应用程序目录：cd survey_system。
配置数据库：默认情况下，Rails使用SQLite数据库。为了使用MySQL，需要编辑config/database.yml文件，将adapter设置为mysql2，并配置数据库的用户名、密码和主机。
创建问卷和问题模型：在命令行中，使用rails generate model Survey title:string命令创建问卷模型。然后，使用rails generate model Question content:string survey:references命令创建问题模型。运行数据库迁移命令以创建表：rails db:migrate。
设置模型之间的关系：在app/models/survey.rb文件中，添加关联关系：has_many :questions。在app/models/question.rb文件中，添加关联关系：belongs_to :survey。
创建问卷和问题的控制器：在命令行中，使用rails generate controller Surveys命令创建问卷的控制器。然后，使用rails generate controller Questions命令创建问题的控制器。
设计问卷和问题的视图：在app/views/surveys文件夹下创建问卷的视图文件。在app/views/questions文件夹下创建问题的视图文件。
实现问卷和问题的功能：在问卷的控制器中，添加创建、编辑、删除等问卷的功能。在问题的控制器中，添加创建、编辑、删除等问题的功能。
添加路由：在config/routes.rb文件中，添加问卷和问题的路由。
运行应用程序：在命令行中，使用rails server命令启动Rails服务器。在浏览器中，访问http://localhost:3000来查看应用程序。
以上是一个简单的指南，可以根据具体需求进行进一步的开发和定制。