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这篇文章主要为大家展示了“CIRCpedia数据库怎么用”，内容简而易懂，条理清晰，希望能够帮助大家解决疑惑，下面让小编带领大家一起研究并学习一下“CIRCpedia数据库怎么用”这篇文章吧。
CIRCpedia是一个综合性的环状RNA数据库，采用CIRCexplorer软件分析了来自6个物种约180多个样本的转录组数据，识别到了262782个环状RNA,网址如下
http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/
各个物种环状RNA的数据量汇总如下
表格数据对应的环形图示意如下
可以看到，绝大部分还是人和小鼠的环状RNA,对于这两个物种的环状RNA,提供了保守性分析的结果。通过官网的4大功能，我们可以方便的探究不同物种的环状RNA数据，分析在不同组织和样本中的表达量信息。
可以通过物种，细胞系，基因名称或者基因组位置，circpedia中的环状RNA ID进行检索，检索框示意如下
检索结果示意如下
给出了环状RNA ID,来源基因，对应的线性转录本，表达量，外显子的起始和终止位置，细胞系，保守性等信息。
通过JBowse基因组浏览器查看相关数据，示意如下
可以方便的下载数据库中的信息，示意如下
可以用热图或者散点图的形式展现环状RNA在不同组织或者细胞系中的表达量，示意如下
第一步输入环状RNA ID, 第二步选择物种，第三步选择细胞系，可以多选，第四步选择图表类型，然后点击Draw按钮，在右边的面板会显示对应的结果。
通过该数据库的在线工具，可以方便的探究不同物种的环状RNA和不同细胞系中环状RNA的表达量。
以上是“CIRCpedia数据库怎么用”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！相信大家都有了一定的了解，希望分享的内容对大家有所帮助，如果还想学习更多知识，欢迎关注亿速云行业资讯频道！
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